Creada en 1959 como Escuela de Farmacia y Bioquímica, en 1967 se hace facultad. Actualmente, en la Facultad de Ciencias Químicas de la Universidad Católica de Córdoba se dictan dos carreras de grado: Farmacia y Bioquímica, y dos carreras de postgrado: Magíster en Tecnología de los Alimentos y Especialidad en Bioquímica Clínica: Área Hematología.

La Facultad organiza su currícula con  un ciclo inicial  común de dos años, y un ciclo superior de dos años  y medio  para Farmacia y de tres para Bioquímica.